皮蝇幼虫 牦牛皮蝇幼虫的RFLP快速鉴定

  摘要:从牦牛皮下采集皮蝇(Hypoderma)幼虫,用DNA提取试剂盒、Chelex-100两种方法提取幼虫的基因组DNA;通过PCR扩增线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因(COⅠ)中的高度可变序列,扩增产物经BfaⅠ酶切后用琼脂糖凝胶检测,结果表明所采集的皮蝇幼虫属于同一种。测序结果显示,扩增的序列与GenBank中中华皮蝇(H. sinense)相应序列的相似性为99.56%,表明所采集的皮蝇幼虫均为中华皮蝇。
  关键词:牦牛;皮蝇(Hypoderma)幼虫;RFLP;细胞色素氧化酶Ⅰ;鉴定
  中图分类号:S852.74+3 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2012)07-1477-04
  
  RFLP Rapid Identification of Hypoderma Larva Affecting Yaks
  
  LIU Hao-hao1,LI Yu-ping2,HUANG Zhi-hong1,XU Ya-ou1,JIN Su-yu1,LIN Ya-qiu1, ZHENG Yu-cai1
  (1.College of Life Science and Technology, Southwest University for Nationalities, Chengdu 610041,China;
  2.Animal Husbandry Bureau of Jiulong County, Jiulong 622000,Sichuan,China)
  
  Abstract: RFLP and sequencing was used to identify the Hypoderma larvae collected from yaks. DNA of larvae was extracted by Genomic DNA Extraction Kit and Chelex-100 method. The variable region of the mitochondrial cytochrome oxidase Ⅰ gene (COⅠ) was amplified by PCR. BfaⅠ digestion and agarose gel electrophoresis revealed that the collected larvae belonged to one species. Sequencing and alignment showed that the amplified sequence shared 99.56% homology with that of H. sinense in GenBank, suggesting that the collected larvae were H. sinense.
  Key words: yak; Hypoderma larva; RFLP; cytochrome oxidase Ⅰ; identification
  
  牦牛皮蝇蛆病是牦牛中常见的一种寄生虫病,该病发病率高,尤其是在1~2岁的幼龄牦牛中[1]。被皮蝇幼虫感染的牦牛会出现产奶量下降、体重减少等症状,另外皮革的质量也会受损,这将严重影响藏区畜牧业的发展[2,3]。因此,加强该病的监测及防治工作非常重要。侵袭牦牛的皮蝇种类有很多,在我国主要有中华皮蝇(Hypoderma sinense)、牛皮蝇(H. bovis)、纹皮蝇(H. lineatum)3种[1,2],其中又以中华皮蝇最为常见。有资料统计,在藏区患皮蝇蛆病的牦牛中,大约有90%是被中华皮蝇感染,剩余两种皮蝇各占5%左右[4]。
  皮蝇种类的鉴定方法已经有很多,最常见的是通过形态学特征与分子生物学特征鉴定。前者主要是用扫描电子显微镜观察皮蝇3期幼虫气门板的形态以及体节腹面突棘的分布情况[1,2,5],后者则是根据线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)[1,4-7]、核糖体28 S亚基[1]等基因的序列特征。虽然不同种类的皮蝇幼虫形态有一些差异,但是形态学鉴定需要扫描电子显微镜等大型设备,操作不是很方便。本研究使用分子生物学方法,改良皮蝇幼虫DNA的提取方法,进行RFLP及测序分析鉴定采集到的牦牛皮蝇幼虫,以期建立一种快速、可靠的牦牛皮蝇幼虫鉴定方法。
  1 材料与方法
  1.1 样品的采集
  牦牛皮蝇幼虫采自四川省九龙县,在牦牛屠宰时采集4头牦牛的皮下幼虫(n=11),迅速冰冻,送至实验室后保存于-80 ℃超低温冰箱。
  1.2 主要仪器及试剂
  主要仪器:电动匀浆器(瑞士Polytron PT1200E)、Mastercycler EP梯度PCR仪(Eppendorf)、Power Pac 3000电泳仪(Bio-Rad)、Versa Doc 1000凝胶成像系统(Bio-Rad)。主要试剂:TaKaRa基因组DNA提取试剂盒(宝生物工程(大连)有限公司)、2×Taq Master Mix(天根生化科技(北京)有限公司)、Chelex-100(Bio-Rad)、BfaⅠ(Ferments)等,引物由上海英骏生物技术有限公司合成。
  1.3 皮蝇幼虫DNA的提取
  牦牛皮蝇2期或3期幼虫称重后,加入10倍体积匀浆液(0.01 mol/L Tris-Cl,pH 8.0),用电动匀浆器在冰上匀浆,9 330 r/min 4 ℃离心20 min,上清液保存于-80 ℃备用。
  采用两种方法提取牦牛皮蝇幼虫DNA。①取皮蝇幼虫匀浆液250 μL,参照TaKaRa基因组DNA提取试剂盒从全血中提取DNA的方法进行;②参照Amills等[8]的Chelex-100方法,取幼虫匀浆液200 μL,用50 g/L的Chelex-100提取DNA。提取的DNA用琼脂糖凝胶电泳检测,并用核酸蛋白检测仪测定其浓度。
  1.4 皮蝇幼虫的分子生物学鉴定
  使用Otranto等[7]设计的引物UEA7(5′-TACAG
  TTGGAATAGACGTTGATAC-3′)和UEA10(5′-TCC
  AATGCACTAATCTGCCATATTA-3′)扩增皮蝇幼虫细胞色素氧化酶Ⅰ基因(COⅠ)中编码第四外环到羧基端(E4-COOH)的片段。PCR体系包括:2×Taq Master Mix 12.5 μL,超纯水8 μL,DNA模板2.5 μL,10 μmol/L UEA7和UEA10 各1 μL。PCR扩增程序为:94 ℃ 12 min;94 ℃ 1 min,60 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,38个循环;72 ℃ 7 min;16 ℃保存[5]。扩增产物用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测,同时选取1个PCR产物直接进行双向测序。
  PCR扩增产物用限制性内切酶BfaⅠ酶切,反应体系包括PCR产物2.5 μL,超纯水15 μL,Buffer 2 μL,BfaⅠ 0.5 μL。37 ℃酶切11 h后用2.0%的琼脂糖凝胶电泳检测。
  2 结果与分析
  2.1 皮蝇幼虫COⅠ基因的PCR扩增结果
  皮蝇幼虫COⅠ基因编码E4-COOH片段的PCR扩增结果见图1。其中1~3号DNA为试剂盒法提取,4~6号DNA由Chelex-100法提取,二者扩增效果相同,均获得了单一的、长约700 bp的条带。
  
  2.2 皮蝇幼虫COⅠ基因PCR产物酶切
  皮蝇幼虫COⅠ基因编码E4-COOH片段的PCR产物经BfaⅠ酶切、电泳检测显示,所有个体均获得了2条大小分别约为420 bp和270 bp的条带(图2),表明采集的皮蝇幼虫均属于同一种。
  2.3 皮蝇幼虫COⅠ基因PCR产物的测序及比对结果
  选取1只皮蝇幼虫COⅠ基因编码E4-COOH片段的PCR产物进行双向测序,拼接后与GenBank中中华皮蝇、牛皮蝇、纹皮蝇COⅠ基因中编码E4-COOH片段的序列(GenBank登录号分别为:AY350769、AF497761、AF497762)进行比对(图3)。结果发现该序列与中华皮蝇的相应序列只有3个碱基的差异,差异位点分别为63、339、544,两者序列一致性达到了99.56%;而与牛皮蝇、纹皮蝇则分别有60个、47个碱基的差异,相应的序列一致性分别为91.28%、93.17%,表明本试验所采集的牦牛皮蝇幼虫均为中华皮蝇。
  
  3 讨论
  有报道显示,在青藏高原牧区患皮蝇蛆病的牦牛中,大约有90%是由于中华皮蝇的感染[4]。本研究根据皮蝇幼虫COⅠ基因中编码E4-COOH片段的RFLP分析以及序列比对结果,并参考Otranto等[1]的研究结果,证实所采集的牦牛皮蝇幼虫均为中华皮蝇,与之前的报道相符[4,9]。用分子生物学方法鉴定牦牛皮蝇种类的相关研究已有不少报道[1,4-7,9],该法在其他动物的皮蝇幼虫鉴定中也获得了可靠的结果[10-12]。与形态学方法相比,分子生物学方法结果准确可靠,操作也较简单,同时不需要大型仪器设备,应用前景广阔。
  本研究在皮蝇幼虫DNA的提取过程中采用Chelex-100方法,取得了很好的效果。该方法提取的DNA用作PCR模板时,与试剂盒提取DNA的效果相差不大,但该法操作简单、成本低、污染小,尤其适合高通量的DNA提取。这为今后牦牛皮蝇幼虫的大规模鉴定提供了可靠、有效的方法。
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